花蓮忠烈祠位於花蓮市林森路底的美崙山一帶，日治時期，這裡是花蓮港神社。根據1943年（昭和18年）臺灣總督府文教局社會課編印的《臺灣?於??神社及宗教》記載，花蓮港神社於1916年（大正5年）9月22日鎮座，1921年（大正10年）3月2日列格為縣社，祭神為開拓三神──大國魂命、大己貴命、少彥名命，以及北白川宮能久親王。例祭日是每年的10月28日。

戰後，花蓮港神社被改建為花蓮忠烈祠，祀有鄭成功、劉永福、邱逢甲等及對國家民族有貢獻者之英雄烈士，現僅保留神社銅製神馬及擋土牆等部分建築。

日治時期，花蓮港神社曾是花蓮港民眾舉行婚喪喜慶、歌舞儀式的重要場域；戰後雖改制為忠烈祠，但是在花蓮阿美文化村成立之前，因其地點便利、空間寬廣，許多阿美族的歌舞表演場地多半會選擇在此地或美軍招待所舉行。

《花蓮縣誌》記載，1964年10月12日，花蓮縣政府在忠烈祠舉行阿美族歌舞大會，連演四場，當時前來欣賞的觀眾超過一千餘人，盛況空前，其中還包括回國華僑，連非洲上伏塔（Upper Volta）新聞局長薛勤巴都專程抵花參觀阿美族的歌舞大會。